Rのインストール R（アール）は統計・データ解析・統計グラフ作成のためのオープンソースソフトです。CRAN（「シーラン」または「クラン」、Comprehensive R Archive Network）のミラーサイト（例えば https://cloud.r-project.org など）からダウンロードし、インストールしてください。Windows用、Mac用、Linux用があります。 最近では下図のような RStudio（アール・スタジオ、英語の発音により忠実に書けばアール・ステューディオまたはアール・ストゥーディオ）という統合開発環境（IDE）を介してRを使う人が増えています。Download RStudio Desktop のページからダウンロードしてインストールします。 RStudio。左上ペインがソースエディタ（この図では隠れている）、左下がRコンソール、右上がグローバル環境のオブ
第２回データマイニング+WEB勉強会＠東京の「はじめてでもわかる R言語によるクラスター分析」の内容に関する、ソースコードも以下に記載します。 ※記載しているソースは、R Console上や EclipseでR-Scriptとして、貼り付けそのまま実行可能です。(Rのインストール・環境設定はこちらで、RをEclipseで実行するための方法はこちら) 講義の全体内容・構成は次をご覧下さい。 ・R勉強会： 第２回データマイニング+WEB 勉強会＠東京 (Tokyo.Webmining) を開催しました - 「はじめてでもわかる R言語によるクラスター分析- ・Slideshare:はじめてでもわかる R言語によるクラスター分析 クラスター分析と評価 エントロピー(Entropy)と純度(Purity)の算出関数 #関数：エントロピー(Entropy)算出, ct:クロス集計表 calcEntr
RjpWiki ¤Ï¥ª¡¼¥×¥ó¥½¡¼¥¹¤ÎÅý·×²òÀÏ¥·¥¹¥Æ¥à R ¤Ë´Ø¤¹¤ë¾ðÊó¸ò´¹¤òÌÜŪ¤È¤·¤¿ Wiki ¤Ç¤¹Emacs ¤«¤é R ¤ò»È¤¦ † ESS (Emacs Speaks Statistics) ¤Ï Emacs ¤ä XEmacs ¤«¤é R ¤Ê¤É¤ÎÅý·×²òÀÏ¥¢¥×¥ê¥±¡¼¥·¥ç¥ó¤òÊØÍø¤Ë»È¤Ã¤Æ¤·¤Þ¤ª¤¦¡¤¤È¤¤¤¦ Lisp ¥×¥í¥°¥é¥à¤Ç¤¹¡¥¡Ê¥¹¥¯¥ê¡¼¥ó¥·¥ç¥Ã¥È¡Ë ESS¤¬¤É¤ì¤À¤±¤ìǽΨ¸þ¾å¤ò¤â¤¿¤é¤·¤Æ¤¯¤ì¤ë¤â¤Î¤«¡¢¤Ê¤É¤Ï¡ÖThe R Book¡×p.55--56¤Ë½ö½Ò¤µ¤ì¤Æ¤¤¤Þ¤¹¡£ ↑ News † ºÇ¿·ÈÇ¡§5.3.9 update!¡¡(200
手順距離関数Dist()で類似度を求め、hclust()でクラスタリングし、heatmap()のColv,Rowvオプションにdendrogram()を指定して出力する。プログラム例 library(amap) # Heatmapグラフ作成 # # ファイルの読み込み data <- read.table("test.txt", header=TRUE, row.names=1, sep="\t") # # PDFに出力する pdf() # # 距離関数で類似度のアルゴリズムとしてCosine係数を使用する # (method="pearson")は(1 - cosine)と同義である d1<-Dist(data, method="pearson") d2<-Dist(t(data), method="pearson") # # クラスタリングでAverage Linkageを使用する c
東京電力が福島原発周辺におけるγ線量などの測定データをPDFで随時公開しているが，これを奥村先生がCSV形式に加工して配布なさっている． http://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat/data/ このデータをRのggplot2ライブラリで可視化してみた． CSVデータの特徴 各CSVファイルは以下のような形式になっている． $ head fukushima1.csv 【別紙】福島第一原子力発電所モニタリングカーによる計測状況,,,,,,,,, 計測日,計測時間,計測場所,γ線,中性子線,風向,風速(m/s),,, 3月11日,午後5時30分,体育館付近,49nGy/h,-,-,-,,, ,午後5時40分,正門付近,56nGy/h,-,-,-,,, ,午後5時50分,管理棟,64nGy/h,-,-,-,,, ,午後6時45分,MP-6,56nGy/h,-,
講習会の目的 本講習会は， R についての自習の基盤をつくることを目指します。 たとえ初心者向けの数時間の入門講習でなく１年間の毎週の演習授業であっても，R に関してすべてを説明するのは不可能だと思われます。 R の世界は，縦にはそこそこ深く，横には果てが見えないほど広いです。 CRAN に登録されている R のパッケージは 1000 を超えました。 よって，受講者の幅も広いことですし，受講者各自にとってぴったりな統計解析の実用的な解説をするのはあきらめて， 各自が必要に応じて情報を探し，見つけたものを難なく活用できるようになること，を目標にしました。 ここに自分の求めている分析手法や作図法などの答えがあるとは期待しないで下さい。それは帰ってからのあなたの楽しい仕事です。 R の利用と R 言語 R の根幹は R 言語のインタプリタであり，ユーザはR言語を駆使することでRを操作します。 S
二階堂愛 (Itoshi NIKAIDO) が綴る Hacking is beliveing な日常_ 最もタメになる「初心者用言語」はRです 最もタメになる「初心者用言語」まとめ (リンクされた，THX) うっかりTwitterで乗りおくれた! 最もタメになる「初心者用言語」は R。ってもう誰か書いた?とかつぶやいたら， @dritoshi 書いて！って言われたので，ムリがあるけど俺，がんばった． R Lispを父にSを母に持つ統計解析言語 筋は悪くないよ．CLOSから取り入れた総称的関数が大活躍だし．なのにカッコカッコしてない! もちろんオブジェクト指向プログラミングもできるしユニットテストもあるよ．統計言語だからデータ構造も豊富! ガベコレもあるよ．無名関数もあるよ．例外処理，遅延評価，関数クロージャ，再帰もできるし，自在にベクトル計算ができるから複雑なループを作らなくてもいいよ．
LL魂の実況中継 - 北海道苫小牧市出身のPGが書くブログを見ていると、 樋口 千洋さんという方がLL魂で講演をされていたらしい。どうやら筑波ともちょこっと関係ある方らしいw。Python、RUby、Perlとかに混じってRですって、やったね！！（謎 というわけで（？）Rに関してブックマークの数も30越えてきたっぽいので、メモがてらにまとめてみるテスト。 入門編 http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r.html R on Windows 〜統計モデル 00〜 An Introduction to R R - Åý·×²òÀϤȥ°¥é¥Õ¥£¥Ã¥¯¥¹¤Î´Ä¶ http://phi.med.gunma-u.ac.jp/swtips/R.htmltitle http://phi.med.gunma-u.ac.jp/swtips/R-
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Amazon.co.jp: Rの基礎とプログラミング技法: U.リゲス (著), 石田基広 (翻訳): 本