ゲノム解析におけるランダム配列の使用について 2010.08.25 ゲノムの解析をしている研究で、特定の傾向を示すためにランダム配列と比較して有意であると示す例をしばしば見にする。が、これは複数の意味で間違っていると僕は思う。うちのラボにいる人は僕がこのランダム配列との比較を好まないことを知っていると思うが、明確に説明したことがない(発表の質疑応答ではその時間がない)ため、ここに一度記しておこうと思う。 手短にまとめておくと、僕が考える大きな問題とは、1. 「統計」や「有意」の考え方を間違えている、2. ゲノムの配列はそもそもランダムではない、3. ランダム配列ではなく、ランダムサンプリングの方が適切、という点にまとめられると思う。 まず一番間違えていると思えるのは、残念ながら非常に良く見るが、ある事象とランダム配列におけるその事象のグラフを示し、それらの有意差をt検定ないしZ検定で見てい
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